Вот же интересный баг получился - попробовал ещё пару идей и частично нашёл проблему.
Одновременно с переносом эмулятора на карту памяти я добавил в папку новых образов игр, но не подумал, что это может привести к каким-либо проблемам, а оказывается ещё как смогло - проблема оказалась именно в одной из добавленных игр "Icebreaker II"
Обратил сейчас внимание, что данная игра отображается в списке с иконкой BIOS, а сам бивис не виден в списке вообще. Удалил данную игру и сразу стал виден нормальный бивис и эмулятор перестал тормозить, т.е. проблема решилась. Получается, что эмулятор почему-то попытался использовать данную игру вместо бивиса 0_о других объяснений не вижу. Та же самая картинка, если положить несколько бивисов - виден только один из них и он же используется, так и тут эмулятор счёл игру за свою прошивку и пытался с ней работать...
На скринах видно, что игра отображается как бивис с данной игрой в списке и без неё.
PS: заодно хотелось бы упорядочивание игр по алфавиту в списке, а не по дате добавления.